För tre år sedan flyttade Deco, som har ett förflutet i Porto, Barcelona och Chelsea, till brasilianska Fluminense. Efter 2-0-segern mot Boavista den 30 mars testades han positivit för det vätskedrivande preparatet furosemid.
Enligt AP ska 35-åringen överklaga beslutet och hans advokater säger till brasiliansk media att det resultatet troligtvis beror på ett vitamintillskott.
Fluminense vill inte kommentera händelsen förrän b-provet analyserats och presenteras på fredag.
Deco vann Champions League med Porto 2004 och med Barcelona 2006. Han har tre ligatitlar med Porto, två med Barca och en med Chelsea.