Manchester United inledde bäst, men laget hade oerhört svårt att komma till några heta målchanser.
Efter 36 minuter kom Manchester United i en farlig kontring. Men Welbeck valde att skjuta i stället för att passa till vänster där Ryan Giggs kom helt fri.
Fem minuter senare ville United ha straff då man tyckte att Evras inlägg stoppades av Kellys arm. Men bara några sekunder senare tog hemmalaget ledningen. John Arne Riise var passiv och Evans hittade in till Rooney som klippte in 1-0. Rooneys 21:a ligamål.
I den andra halvleken jagade Fulham en kvittering - och i den sista minuten ville laget ha straff efter att Danny Murphy ramlat i straffområdet.
Man Utd: De Gea, Evra, Ferdinand, Evans, Rafael, Carrick, Giggs, Valencia, Rooney, Young, Welbeck.
Fulham: Schwarzer, Kelly, JA Riise, Hangeland, Hughes, Diarra, Dempsey, Pogrebnyak, Duff, Frei, Dembele.
Referee: Michael Oliver