Italienaren publicerade en bild föreställande tv-spelskaraktären Super Mario via det sociala mediet, men texten som hörde till postningen väckte anstöt. Bland annat stod det att Super Mario "hoppar som en svart man och samlar pengar som en jude", vilket ledde till massiv kritik mot Balotelli.
Via twitter gick 24-åringen i svaromål.
"Min mamma är judisk, så håll käften allihop", skrev han där.
Balotellis ursprungspostning var menad som ett skämt och riktade sig paradoxalt nog mot just rasism, men enligt the Guardian har FA bekräftat att en utredning inletts för att slå fast om forwarden brutit mot fotbollens uppförandekodex. Mer specifikt kan det i så fall handla om att han "vanärat sporten genom att fälla kommentarer syftade att nedvärdera etnisk härkomst eller utseende", skriver the Guardian.
Tidningen uppger också att den ljumskskadade Mario Balotelli fått en reprimand av Liverpool efter händelsen.
På tisdagsmorgonen lade Balotelli ut ett nytt inlägg på instagram där han bad om ursäkt för sin första bild.
"Jag förstår nu att, tagen ur sitt sammanhang, kan bilden få motsatt effekt av vad jag hade hoppats på. Alla mexikaner har inte mustasch, alla svarta människor hoppar inte högt och alla judiska personer älskar inte pengar. Jag använde en serieteckning som någon annan gjort för att jag tyckte att den var rolig och det var inte meningen att den skulle vara stötande. Återigen: Jag är ledsen", skriver Balotelli.