På ett regnigt San Mames kunde Ivan Rakitic nicka in matchens enda mål i den första halvleken, på ett bra inlägg från Arda Turan i den 21:a minuten.
I den andra halvleken hade katalanerna en del bekymmer med baskerna, men förutom en farlig frispark från Benat Etxebarria, lyckades inte Athletic Bilbao skapa de riktigt vassa chanserna och Barcelona tog sin andra raka seger för säsongen.
Full pott har även Las Palmas efter två omgångar - och efter söndagens kross över Granada med 5-1 leder Las Palmas La Liga, på bättre målskillnad än Barcelona.
