Real-mittfältaren missade flera matcher i slutet av säsongen på grund av smärtor i ryggen och ingår inte i den spanska truppen till Confederations Cup.
Nu har Xabi Alonso opererats i München hos en ryggspecialist och kommer att tvingas till en tids konvalecens men klubben har inte gått ut med hur länge 31-åringen väntas vara satt ur spel